Вчений, Великі бібліотеки

Це Крейдл
Білки - це молекулярні машини життя, які використовуються для багатьох терапевтичних, діагностичних, хімічних, сільськогосподарських і харчових застосувань. Розробка та оптимізація білків вимагає багато експертних знань і ручних зусиль завдяки використанню спеціальних обчислювальних і біологічних інструментів.
Машинне навчання революціонізує цей простір, створюючи високоточні білкові моделі. У Cradle ми пропонуємо програмну платформу для виявлення та оптимізації білків під керуванням ШІ, щоб біологи могли проектувати білки швидше та в масштабі. Нами вже користуються клієнти з біофармації, біотехнологій, агротехніки, харчової промисловості та наукових кіл.
Ми — досвідчена команда з трохи менше 100 осіб. Раніше ми створили багато успішних продуктів і маємо достатньо фінансування для багаторічної роботи. Ми розподілені в трьох офісах в Амстердамі, Бостоні та Цюріху разом із кількома віддаленими колегами.
Ми пропонуємо нашим співробітникам дуже конкурентоспроможну заробітну плату, велику частку акцій компанії та широкий спектр переваг і можливостей кар’єрного зростання.

Те, що ми шукаємо
Ми шукаємо (старшого) наукового співробітника, який би приєднався до нашої команди великих бібліотек і керував розробкою нових високопродуктивних можливостей скринінгу взаємодій білок-білок. У цій ролі ви працюватимете над розробкою нових методів скринінгу бібліотек варіантів білків (наприклад, антитіл) для вимірювання афінності зв’язування між білками. Ви розробите інноваційні методи дослідження ландшафтів послідовності функцій, створюючи великомасштабні набори даних. Ці набори даних будуть використовувати моделі платформи Cradle AI/ML, посилювати рекомендації щодо дизайну, прискорювати оптимізацію протеїну та поглиблювати розуміння продуктивності білка. Ваші зусилля дозволять нашим клієнтам розробляти кращі білки швидше в біотехнологічних додатках.

Обов'язки
Розробка та виконання методу

• Розробка та оптимізація нових робочих процесів для високопродуктивного скринінгу бібліотеки взаємодії білок-білок

• Створюйте та оптимізуйте конвеєри аналізу in vitro або на основі клітин за різними методами відображення та скринінгу (дріжджі, фаги, мРНК, рибосомний дисплей або дисплей ссавців)

• Проектувати, створювати та виконувати основи молекулярної біології та біохімії для створення бібліотек, скринінгу та створення даних у масштабі

• Встановіть надійні та повторювані аналізи зі статистичною точністю, необхідною для навчання, оцінки та оптимізації моделей машинного навчання

Технічне лідерство

• Керуйте та керуйте проектами від експериментального проектування до доставки даних

• Визначте можливості для покращення пропускної здатності, якості даних, повторюваності та ефективності робочого процесу.

• Співпрацюйте з міжфункціональною командою для усунення складних технічних проблем і пошуку рішень.

Міжфункціональна співпраця

• Співробітництво з командою ML для визначення вимог до даних та інтеграції експериментальних результатів у конвеєр ML.

• Ефективно передавати результати, ідеї та технічні проблеми в різних дисциплінах.

• Зробіть внесок у формування наукового напрямку команди великих бібліотек і внесіть суттєвий внесок у розвиток платформи Cradle.

Ваше походження
Не вистачає одного чи двох пунктів зі списку нижче? Не хвилюйтеся, якщо ви в захваті від цієї ролі та відповідаєте більшості цих критеріїв, ми обов’язково хочемо почути вас. У формі заявки ви матимете можливість розпалити нашу цікавість, розповівши про щось новаторське, над чим ви працювали.

• Доктор філософії в галузі біохімії, молекулярної біології, біофізики, синтетичної біології, біоінженерії або суміжної галузі.

• Продемонстрована креативність у розробці методів: ви винайшли або суттєво адаптували робочі процеси, а не просто виконали встановлені.

• Захоплення навчанням, внеском і впровадженням інновацій у середовищі стартапу на ранній стадії. Почувайтеся комфортно з неоднозначністю та швидким темпом середовища.

• Сильні вербальні та письмові навички спілкування англійською мовою. Проактивний обмін результатами, успіхами та проблемами в міжфункціональному середовищі.

• Можливість запускати кілька проектів одночасно, забезпечуючи документування етапів процесу та впорядкування фізичних/цифрових даних.

Приємно мати
Досвід роботи з одним або декількома з наступного буде перевагою:

• Методології побудови великомасштабної бібліотеки ДНК (>10^6 варіантів)

• Дисплейні платформи (дріжджі, фаги, мРНК, рибосомний дисплей або дисплей ссавців)

• Проточна цитометрія та FACS

• Знайомство з методами вимірювання кінетики зв’язування (SPR, BLI, ELISA тощо)

• Підготовка бібліотеки секвенування наступного покоління, контроль якості та інструменти біоінформаційного аналізу (Illumina, Nanopore, PacBio).

• Досвід із статистично суворим експериментальним дизайном та оцінкою якості даних

• Високопродуктивний аналіз даних або знання мов сценаріїв (Python, R)

• Класична високопродуктивна автоматизація лабораторії (роботизовані пристрої для обробки рідини, зчитувачі планшетів, збирачі колоній)

Дізнайтеся більше про команду BioEngineering
Ми досить відкрито говоримо про те, над чим працюємо в нашій команді BioEngineering. Якщо ви хочете дізнатися більше, перш ніж подавати заявку, перегляньте публікації в блозі нашої команди (посилання 1, посилання 2) або перегляньте наш вебінар з автоматизації лабораторій.
Наша прихильність інклюзивному найму
Cradle оцінює всіх кандидатів на основі заслуг, незалежно від статі, етнічного походження, соціально-економічного походження чи будь-якого іншого аспекту особистості. Ми зберігаємо нульову терпимість до дискримінації та активно заохочуємо кандидатів із будь-яким професійним становищем подавати заявки.

Розкриття AI
Cradle використовує систему відстеження кандидатів, яка включає базові функції штучного інтелекту, які можуть генерувати оцінки або рейтинги на основі відповідності заявок опису вакансії. Ці результати не використовуються для прийняття чи значущого впливу на рішення про прийом на роботу — усі кандидати оцінюються нашою командою рекрутингу шляхом ретельного аналізу під керівництвом людини…

Джерело: Arbeitnow (https://www.arbeitnow.nl/jobs/companies/cradlebio/scientist-large-libraries-amsterdam-402474)