Επιστήμονας, Μεγάλες Βιβλιοθήκες

Αυτό είναι το λίκνο
Οι πρωτεΐνες είναι οι μοριακές μηχανές της ζωής, που χρησιμοποιούνται για πολλές θεραπευτικές, διαγνωστικές, χημικές, γεωργικές και διατροφικές εφαρμογές. Ο σχεδιασμός και η βελτιστοποίηση πρωτεϊνών απαιτεί πολλές γνώσεις ειδικών και χειρωνακτική προσπάθεια, μέσω της χρήσης προσαρμοσμένων υπολογιστικών και βιολογικών εργαλείων.
Η μηχανική μάθηση φέρνει επανάσταση σε αυτόν τον χώρο, επιτρέποντας μοντέλα πρωτεΐνης υψηλής πιστότητας. Στο Cradle, προσφέρουμε μια πλατφόρμα λογισμικού για ανακάλυψη και βελτιστοποίηση πρωτεϊνών καθοδηγούμενη από AI, έτσι ώστε οι βιολόγοι να μπορούν να σχεδιάζουν πρωτεΐνες πιο γρήγορα και σε κλίμακα. Χρησιμοποιούμαστε ήδη από πελάτες σε βιοφαρμακευτικά προϊόντα, βιοτεχνολογίες, αγροτεχνολογία, τεχνολογία τροφίμων και ακαδημαϊκό κόσμο.
Είμαστε μια έμπειρη ομάδα με λιγότερο από 100 άτομα. Έχουμε δημιουργήσει πολλά επιτυχημένα προϊόντα στο παρελθόν και έχουμε αρκετή χρηματοδότηση για πολλά χρόνια πασαρέλας. Είμαστε κατανεμημένοι σε τρία γραφεία στο Άμστερνταμ, τη Βοστώνη και τη Ζυρίχη, μαζί με μερικούς απομακρυσμένους συναδέλφους μας.
Προσφέρουμε στους υπαλλήλους μας έναν πολύ ανταγωνιστικό μισθό, ένα γενναιόδωρο μετοχικό μερίδιο στην εταιρεία και ένα ευρύ φάσμα παροχών και ευκαιριών εξέλιξης σταδιοδρομίας.

Αυτό που ψάχνουμε
Αναζητούμε έναν (ανώτερο) επιστήμονα για να συμμετάσχει στην ομάδα των Μεγάλων Βιβλιοθηκών μας και να προωθήσει την ανάπτυξη νέων δυνατοτήτων ελέγχου υψηλής απόδοσης για αλληλεπιδράσεις πρωτεΐνης-πρωτεΐνης. Σε αυτόν τον ρόλο, θα εργαστείτε για την ανάπτυξη νέων μεθόδων για τη διαλογή βιβλιοθηκών παραλλαγών πρωτεΐνης (π.χ. αντισώματα) για τη μέτρηση των συνάφειων δέσμευσης αλληλεπίδρασης πρωτεϊνών. Θα αναπτύξετε καινοτόμες μεθόδους για να εξερευνήσετε τοπία ακολουθίας συναρτήσεων, δημιουργώντας σύνολα δεδομένων μεγάλης κλίμακας. Αυτά τα σύνολα δεδομένων θα τροφοδοτήσουν τα μοντέλα πλατφόρμας Cradle AI/ML, θα ενισχύσουν τις προτάσεις σχεδιασμού, θα επιταχύνουν τη βελτιστοποίηση πρωτεϊνών και θα εμβαθύνουν στην κατανόηση της απόδοσης πρωτεΐνης. Οι προσπάθειές σας θα επιτρέψουν στους πελάτες μας να κατασκευάσουν καλύτερες πρωτεΐνες, πιο γρήγορα σε όλες τις εφαρμογές βιοτεχνολογίας.

Ευθύνες
Ανάπτυξη & Εκτέλεση Μεθόδου

• Αναπτύξτε και βελτιστοποιήστε νέες ροές εργασίας για έλεγχο βιβλιοθήκης αλληλεπίδρασης πρωτεΐνης-πρωτεΐνης υψηλής απόδοσης

• Δημιουργία και βελτιστοποίηση αγωγών προσδιορισμού in vitro ή βασισμένων σε κύτταρα σε πολλαπλές μεθόδους εμφάνισης και διαλογής (ζυμομύκητες, φάγοι, mRNA, εμφάνιση ριβοσώματος ή εμφάνιση θηλαστικών)

• Σχεδιασμός, κατασκευή και εκτέλεση πλαισίων μοριακής βιολογίας και βιοχημείας για την κατασκευή βιβλιοθηκών, τον έλεγχο και τη δημιουργία δεδομένων σε κλίμακα

• Καθιερώστε ισχυρές και επαναλαμβανόμενες αναλύσεις με τη στατιστική αυστηρότητα που απαιτείται για εκπαίδευση, αξιολόγηση και βελτιστοποίηση μοντέλων ML

Τεχνική Ηγεσία

• Οδηγήστε και οδηγήστε έργα από τον πειραματικό σχεδιασμό μέσω της παράδοσης δεδομένων

• Προσδιορίστε ευκαιρίες για βελτίωση της απόδοσης, της ποιότητας δεδομένων, της επαναληψιμότητας και της αποτελεσματικότητας της ροής εργασίας.

• Συνεργαστείτε με μια πολυλειτουργική ομάδα για την αντιμετώπιση σύνθετων τεχνικών προκλήσεων και την επανάληψη λύσεων.

Διαλειτουργική Συνεργασία

• Συνεργαστείτε με την ομάδα ML για τον καθορισμό των απαιτήσεων δεδομένων και την ενσωμάτωση των πειραματικών αποτελεσμάτων στον αγωγό ML.

• Επικοινωνήστε αποτελεσματικά τα αποτελέσματα, τις γνώσεις και τις τεχνικές προκλήσεις σε όλους τους κλάδους.

• Συμβάλετε στη διαμόρφωση της επιστημονικής κατεύθυνσης της ομάδας των Μεγάλων Βιβλιοθηκών και συμβάλλετε ουσιαστικά στην πρόοδο της πλατφόρμας Cradle.

Το ιστορικό σας
Σας λείπουν ένα ή δύο σημεία από την παρακάτω λίστα; Μην ανησυχείτε, αν είστε ενθουσιασμένοι με αυτόν τον ρόλο και πληροίτε τα περισσότερα από αυτά τα κριτήρια, σίγουρα θέλουμε να ακούσουμε νέα σας. Στη φόρμα αίτησης θα έχετε την ευκαιρία να εξάψετε την περιέργειά μας λέγοντάς μας κάτι πρωτοποριακό στο οποίο έχετε εργαστεί.

• Διδακτορικό διδακτορικό στη βιοχημεία, τη μοριακή βιολογία, τη βιοφυσική, τη συνθετική βιολογία, τη βιομηχανική ή σε συναφή τομέα.

• Αποδεδειγμένη δημιουργικότητα στην ανάπτυξη μεθόδων: έχετε εφεύρει ή ουσιαστικά προσαρμόσει ροές εργασιών, όχι απλώς εκτελέσει καθιερωμένες.

• Ενθουσιασμός για τη μάθηση, τη συμβολή και την προώθηση της καινοτομίας σε ένα αρχικό περιβάλλον εκκίνησης. Να είστε άνετοι με την ασάφεια και το περιβάλλον με γρήγορο ρυθμό.

• Ισχυρές δεξιότητες προφορικής και γραπτής επικοινωνίας στα Αγγλικά. Προληπτική κοινή χρήση αποτελεσμάτων, επιτυχιών και προκλήσεων σε ένα διαλειτουργικό περιβάλλον.

• Δυνατότητα εκτέλεσης πολλαπλών έργων ταυτόχρονα, διασφαλίζοντας ταυτόχρονα ότι τα βήματα της διαδικασίας είναι τεκμηριωμένα και οργανωμένα φυσικά/ψηφιακά δεδομένα.

Ωραίος
Εμπειρία σε ένα ή περισσότερα από τα παρακάτω θα θεωρηθεί πλεονέκτημα:

• Μεθοδολογίες κατασκευής βιβλιοθήκης DNA μεγάλης κλίμακας (>10^6 παραλλαγές)

• Πλατφόρμες εμφάνισης (εμφάνιση ζυμομυκήτων, φάγων, mRNA, εμφάνισης ριβοσώματος ή εμφάνισης θηλαστικών)

• Κυτταρομετρία ροής και FACS

• Εξοικείωση με τεχνικές δεσμευτικής κινητικής μέτρησης (SPR, BLI, ELISA κ.λπ.)

• Προετοιμασία βιβλιοθήκης αλληλουχίας επόμενης γενιάς, QC και εργαλεία βιοπληροφορικής ανάλυσης (Illumina, Nanopore, PacBio).

• Εμπειρία με στατιστικά αυστηρό πειραματικό σχεδιασμό και αξιολόγηση ποιότητας δεδομένων

• Ανάλυση δεδομένων υψηλής απόδοσης ή εξοικείωση με γλώσσες δέσμης ενεργειών (Python, R)

• Κλασικός εργαστηριακός αυτοματισμός υψηλής απόδοσης (ρομποτικοί χειριστές υγρών, συσκευές ανάγνωσης πιάτων, συλλέκτες αποικιών)

Μάθετε περισσότερα για την ομάδα BioEngineering
Είμαστε αρκετά ανοιχτοί για το τι εργαζόμαστε στην ομάδα BioEngineering. Εάν θέλετε να μάθετε περισσότερα πριν υποβάλετε αίτηση, ρίξτε μια ματιά στις αναρτήσεις ιστολογίου από την ομάδα μας (σύνδεσμος 1, σύνδεσμος 2) ή παρακολουθήστε το διαδικτυακό σεμινάριο μας για την αυτοματοποίηση εργαστηρίου.
Η δέσμευσή μας για προσλήψεις χωρίς αποκλεισμούς
Το Cradle αξιολογεί όλους τους υποψηφίους με βάση την αξία τους, ανεξάρτητα από φύλο, φύλο, εθνικότητα, κοινωνικοοικονομικό υπόβαθρο ή οποιαδήποτε άλλη πτυχή της ταυτότητας. Διατηρούμε μηδενική ανοχή στις διακρίσεις και ενθαρρύνουμε ενεργά τους υποψηφίους από κάθε υπόβαθρο να υποβάλουν αίτηση.

Αποκάλυψη AI
Το Cradle χρησιμοποιεί ένα σύστημα παρακολούθησης αιτούντων που περιλαμβάνει βασικές λειτουργίες υποβοηθούμενες από AI, οι οποίες ενδέχεται να δημιουργήσουν βαθμολογίες ή βαθμολογίες με βάση τον τρόπο με τον οποίο οι εφαρμογές αντιστοιχούν σε μια περιγραφή εργασίας. Αυτά τα αποτελέσματα δεν χρησιμοποιούνται για να ληφθούν ή να επηρεάσουν ουσιαστικά τις αποφάσεις πρόσληψης — όλοι οι υποψήφιοι αξιολογούνται μέσω μιας διεξοδικής, ανθρωποκεντρικής επανεξέτασης από την ομάδα προσλήψεών μας.…

Πηγή: Arbeitnow (https://www.arbeitnow.nl/jobs/companies/cradlebio/scientist-large-libraries-amsterdam-402474)